信息工程学院成立于2003年，学院充分结合北京大学的学科优势和深圳的信息产业优势，探索产学研一体化的办学新模式。信息工程学院目前开设的招生专业有：微电子学与固体电子学(理学硕士、博士)、集成电路与系统(理学硕士、博士)、计算机应用技术(理学硕士、博士)。研究方向包括：微纳电子器件与集成技术、集成系统芯片(SOC)、微电子机械系统（MEMS）技术、系统芯片设计验证与测试、网络通信与信息安全、多媒体技术、网络信息工程、人机交互与机器人系统等。学院在“前沿领域、交叉学科、应用学术、国际标准”方针的指引下，建立了集成微系统科学工程与应用（国家级）重点实验室。 信息工程学院大力开展产学研合作，自2002年成立以来，先后与珠三角地区多家知名企业和科研院校在科研项目合作、人才培养等方面建立了广泛的合作关系，也得到了政府部门的大力支持，融入了深港粤产学研创新体系。目前，信息工程学院已培养毕业生400多人，多数毕业生在北京、上海、深圳、广州、香港等地高新技术企业任职。
化学生物学与生物技术学院创建于2003年，现设有化学基因组学实验室、转化医学中心和纳米微米材料研究中心。学院以研发具有自主知识产权的抗癌抗病毒创新药物为主攻方向，旨在融合现代有机合成化学、药物化学、生物学、计算和生物信息学等关键前沿领域，建设一个现代化的药物研发创新平台，培养交叉复合型高层次生物医药研发人才，为深圳市和国家生物医药产业的快速发展提供高端人才支撑服务。
2007年，化学生物学与生物技术学院申报的化学基因组学被批准成为中国第一个化学基因组学国家二级学科博士授予点。学院在2009年11月获得北京大学“985工程”二期建设项目立项，该项目属于建设重点项目，建设经费为3000万元。化学生物学与生物技术学院化学基因组学实验室不仅是深圳市重点实验室和广东省重点实验室，还在2010年2月获得国家科技部的正式批复，成为省部共建国家重点实验室的培育基地。
化学生物学与生物技术学院汇聚了国际领先水平的科研队伍，一批在世界著名科研机构作出重大发现的科学家纷纷加盟学院。学院实行课题组长负责制（即PI制），各研究室围绕新药研发中的核心问题，运用交叉学科的研究方法，充分发挥有机合成化学、生物学、理论计算化学和材料学等学科相互交叉融合的功能和作用，协同攻关，密切配合，在抗癌和抗病毒药物研究及相关领域开展工作。学院采用化学与生物学综合授课的教学模式，积极适应我国新药发展对高层次科研人员的迫切需求。
在各方的精诚努力下，化学生物学与生物技术学院将成为中国培养从事生命科学和药物研发的高层次人才的重要基地，为我国创新药物的研发注入强劲持久的学术动力。
环境与能源学院在原有学科基础上组建于2009年，学院的办学目标是：建立新环境能源前沿学科，树立低碳科研教学典范，教育并储备有能力解决环境能源问题的科技人才，提供解决区域和全球性能源和环境问题的技术方案。学院注重建立与公众、政府和企业团体长期互动合作机制，共同努力为满足人类社会对能源和环境可持续发展的需求服务。
环境与能源学院在北京大学本部环境科学与工程、生物学、等传统优势学科的基础上，结合深圳校区的学术资源，开展环能新兴交叉学科的研究领域与学生培养学科。学院将综合考虑环境与能源问题，在解决环境问题的同时解决能源问题。我们研究主要方向是把环境中的废弃物、污染物资源化、能源化，并开发再生能源新技术。学院将积极促进低碳经济推广前沿技术应用 ，探索改善全球气候极端化的造因。
环境与能源学院科研工作围绕城市人居环境科学与技术、低碳新能源研究展开。现设有城市人居环境科学与技术重点实验室，下设环境与工程实验室、环境与健康实验室。在低碳新能源研究领域设有水污染控制与资源化实验室、大气环境模拟实验室、环境与能源信息实验室、城市废物处理与利用实验室、绿色照明系统实验室、环境生物能源实验室等。
环境与能源学院目前设置了环境科学和环境工程两个招生专业，研究方向包括环境规划与管理、环境与健康、水科学与环境信息、水处理与资源工程、环境微生物、能效工程、生物能源工程。目前学院在校硕士和博士研究生110人。
城市规划与设计学院在原有学科基础上组建于2009年，学院的目标是：发挥北京大学多学科优势，因应大珠江三角洲地区快速城市化成功经验，探索中国在全球变化背景下城市化的全新路径，把本院办成中国新城市化研究的先行者和推动者，成为北京大学城乡发展建设研究和专业技术一流人才培养的重要基地，为推进中国城市化和可持续发展做出独特的贡献。 学院设有地理学（城市与区域规划）和地理学（景观设计学）两个硕士生招生专业，并依托北京大学城市与环境学院自然地理学和人文地理学两个博士点招收博士研究生。上述专业自2002年开始招收研究生以来，累计招收硕士研究生336人，博士研究生32人。目前学院全日制在校学生196人。 学院设有人居环境科学与技术（国家级）重点实验室地学基础、应用生态学和数字城市3个分室，深圳市循环经济重点实验室、北京大学香港大学深港发展与创新研究中心、景观生态学与数字城市研究中心、中国城市设计研究中心、土地经济与住房政策研究中心、生态修复与废物资源化技术研究中心及景观设计学系等科研和教学平台。
北京大学汇丰商学院（原为北京大学深圳商学院）创办于2004年，是集教学、研究和社会服务于一体的学院。2008年8月，汇丰银行慈善基金捐赠冠名北京大学汇丰商学院，学院进入高速发展时期。 学院的目标是打造世界一流商界军校，为未来培养商界领袖。学院充分利用深圳独特的创新环境和毗邻香港国际大都会的有利条件，发挥北京大学的科研优势，汇聚了来自世界知名大学的优秀师资，“立足深圳、面向世界”，致力于为政府决策部门、研究机构、企业以及各类金融机构培养具有扎实理论基础、较强实际工作能力的高级经济研究与管理人才。
学院开设了“北京大学经济学-香港大学金融学双硕士”、“北京大学管理学-香港大学金融学双硕士”和“北京大学金融学硕士”三个全日制研究生招生项目，同时招收西方经济学和企业管理专业博士研究生及EMBA。学院设有“中国与全球经济发展研究中心”、“实践家商业模式研究中心”、“北京大学汇丰金融研究院”等研究机构，并开设了“FIP金融证券与投资理财课程 ”、“高级工商管理课程”等多个培训项目。 2009年，汇丰商学院被AACSB接纳为会员，进入正式的认证程序，同年成功通过欧洲EFMD组织会员身份审查委员会的审批。汇丰商学院凭借“商界军校”独特的办学模式，目前已经成为中国最具影响力的商学院之一。
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