化学基因组学实验室隶属于化学生物学与生物技术学院，由生物、合成和计算化学领域优秀的专家组成极富竞争力的交叉学科科研团队，致力于抗病毒和抗肿瘤药物的研究，开发自主知识产权的技术和药物，并以交叉学科研究为特色培养生物医药研发的优秀人才，目前已经成功构建了合成化学、生物活性筛选、动物模型和生物技术等研究平台，在开展基础科学研究的同时积极为生物医药相关产业发展做出贡献。
经过几年的努力，实验室在2007年获得广东省重点实验室建设项目立项，成为深圳市四家广东省重点实验室之一；2009年在深圳市重点实验室评估中获得优秀；2010年，成为省部共建国家重点实验室培育基地。
城市人居环境科学与技术实验室分属于环境与能源学院和城市规划与设计学院，实验室立足深圳、辐射珠三角，开展居室、社区、城市区域三个层次的综合研究和技术开发，促进可持续人居环境的健康发展，实验室在深圳和珠三角地区开展了室内外大气环境和水环境污染成因及控制研究，在城市规划、生态规划、环境规划等方面取得显著成绩。
北京大学深圳研究生院拥有一支高水平国际化的师资队伍，其中68%具有副教授以上职称，90%具有博士学位，外籍教师30人，其中包括中国科学院院士3人、中国工程院院士1人、长江学者4人。北京大学深圳研究生院另有博士后研究人员29人。
北大深圳研究生院各学科以具备国际视野和一流学科建设经验的学术带头人为中心形成了富有特色的学术团队，初步形成了“大师当龙头、留学归国及国内优秀中青年专家学者作中坚、博士后为补充”的“三位一体”的人才梯队。
国际化是深圳研究生院师资队伍的重要特征，以康奈尔大学前校长杰弗里·雷蒙为代表的一批曾经执教于哈佛大学、康奈尔大学、加州大学的外籍教师，和以吴云东、杨震、林硕、肖瑞平为代表的一批在世界著名科研机构做出世界级发现的华人科学家纷纷加盟北大深圳研究生院，极大地提升了深圳研究生院教学科研的国际化水平；此外，深圳研究生院青年教师也绝大多数拥有哈佛、MIT、斯坦福、加州大学、康奈尔等世界一流大学的教育背景，极具创新活力。
北京大学深圳研究生院吸引了国内外最优秀的学生，截至2009年底，全院在校研究生共有1925人，其中，博士研究生190人，硕士研究生1735人。2008年起，深圳研究生院开始招收港澳台学生。2009年，第一批留学生入学。随着越来越多的外国留学生的到来，南国燕园的学生构成日益丰富并富于国际化色彩。
南国燕园校园文化传承北大传统，融合深圳精神，更具新时代的特征。丰富多彩的研究生校园文化体现了师生肩负使命、勇于担当，兼容并包、追求真理，激情洋溢、青春活泼的精神气质，为百年北大精神注入了新的活力。随着深圳研究生院世界一流国际化校区建设的逐步推进，国际化也成为南国燕园校园文化的重要元素，一个开放多元、海纳百川的校园文化新格局正在形成。
学术研究是研究生校园文化的主旋律，南国燕园一系列品牌论坛、讲座，如“北大深圳论坛”、“全球经济论坛”等，营造了浓厚的学术氛围。深圳研究生院大力提倡理论与实践相结合的学术研究，专门设立院长科研基金，鼓励学生进行创新研究，同时引导同学们积极参加北京大学挑战杯竞赛及国内外各层次竞赛；在学术组织方面，研究生会下设学术部，目前有8个学术类社团，平均每年开展几十场专业学术讲座。
南国燕园文体活动精彩纷呈。五四青年文化节、社团文化节定期举行；南燕艺术团汇聚100多名同学，兴趣相投，切磋技艺；校园文体设施完善，健身馆、舞蹈室、足球、篮球、排球、网球场地一应俱全，各种文体赛事让同学们尽情挥洒青春。2007年起，深圳研究生院每年组团参加北京大学春季全校运动会并取得优异成绩。近年来，校园文化不断走向品牌化、国际化。其中新生文艺汇演、“五四”校园歌手大赛、戏剧之夜、文化之夜、“镜湖之夜”新年嘉年华活动、“一二、九”朗诵大赛、定向越野等活动已经成为活动品牌。随着外籍教师与留学生的增加，他们也带来具有原滋原味异国情调的文体活动，校园文化开放多元性进一步体现。
关心社会、勇于担当是北大人的一贯传统。深圳研究生院所在的珠三角地区是中国改革开放的前沿，新的社会现象尤为突出，深圳研究生院学生充分发挥专业优势，立足深圳，服务社会，开展了大量卓有成效的社会实践活动，并形成了扎实深入的调研成果，促进了大学与社会之间的互动。
国际交流是研究生拓展视野，融入全球化真实情境的重要渠道。汇丰商学院的同学们利用暑假，在加州大学度过为期2个月的选修课学习生活；每届景观设计学的同学都要进行为期1个月的欧洲学习之旅，颇有游学意味；深圳校区还利用毗邻港、澳、台的区位优势，为同学们创造了与香港大学、香港中文大学、香港科技大学、台湾成功大学、政治大学等著名高校常态化交流的机会。
公益志愿类：青年志愿者协会、红树林协会
实践促进类：南燕新闻社、南风心理学社、证券投资协会、管理咨询协会、演讲与辩论协会、学生职业发展协会
南国燕园报
体育健身类：南燕车协、排球协会、乒乓球协会、足球协会、篮球协会、网球协会、塑形与健身协会、轮滑协会、 高尔夫球协会、羽毛球协会
文化艺术类：彼岸戏剧社、Moviekids电影协会、五四文学社、灵风舞协、音乐协会、青年思语刊物、摄影协会、融德国际戏曲协会、国际文化交流协会、辋川书画社
学术科创类：信息技术协会、深港经济金融协会、经济政策协会（EPA）、英语协会、资本市场协会、博雅金融学社、投律协会、亚太地区企业家精神协会（ASES）、商业银行精英社（CBES）
北京大学深圳研究生院独特的学科与学位基础条件与品牌优势吸引了中国最优秀的学生在这里深造。
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